Establish the network of gene expression regulation of the seed and analysis of its biodiversity
Informations
- Funding country
France- Acronym
- ARABIDO-SEED
- URL
- -
- Start date
- 11/4/2005
- End date
- 11/4/2007
- Budget
- 105,550 EUR
Fundings
| Name | Role | Start | End | Amount |
|---|---|---|---|---|
| GPLA Réseau de Génomique végétale - GENOPLANTE | Grant | 11/4/2005 | 11/4/2007 | 105,550 EUR |
Abstract
L’accumulation des réserves des graines durant la maturation de la graine est sous le contrôle d’une diversité de régulateurs parmi lesquels plusieurs facteurs de transcription (FT) sont connus pour jouer un rôle majeur. Le but de ce projet sera : 1. De caractériser le réseau des gènes qui sont sous le contrôle des FT exprimés dans la graine par l’analyse du transcriptome des mutants KO défectifs pour chacun de ces FT en utilisant la puce CATMA. 2. D’identifier les cibles ADN des FT ayant le rôle le plus important de l’expression des gènes de la graine en utilisant la technique des ChIP/Chip sur une version améliorée de la puce promoteur SAP. 3. Par l’analyse de la variabilité des transcrits exprimés dans la graine mesurée par PCR quantitative et utilisation de la puce CATMA sur une collection de lignées recombinantes inbred (RIL) issues du croisement entre deux parents montrant des caractéristiques contrastées au niveau de leur graine. Ces QTLs identifieront des locis jouant un rôle majeur dans le contrôle de l’expression des gènes dans la graine, dans l’accumulation des composés des réserves et d’autres caractéristiques de la graine. Cette approche globale permettra de déterminer les bases moléculaires de la biodiversité des caractéristiques de la graine chez une dicotylédone ouvrant la voie à l’amélioration de la qualité des graines des plantes cultivées.